Научные школы – это всегда коллективы и так повелось в науке, что каждая из них носит имя своего основателя и учителя. В настоящее время в Институте молекулярной биологии и биохимии им. М.А. Айтхожина успешно продолжают развиваться заложенные ранее направления пяти научных школ:
- Школа академика АН КазССР М.А. Айтхожина, лауреата Ленинской премии, основателя молекулярной биологии в Казахстане (ученик академика АН СССР, лауреата Ленинской премии Спирина Александра Сергеевича, директора Института белка РАН). Основное научное направление школы – «Биосинтез белка и молекулярные основы его регуляции». Данное направление активно развивается и поддерживается в настоящее время Лабораторией белка и нуклеиновых кислот (зав. Лаб. д.б.н. Исаков Б.К.). Профессор Б.К. Искаков является продолжателем научной школы академика М.А. Айтхожина в области изучения молекулярных механизмов и регуляции биосинтеза белка у растений и подготовил учеников: к.б.н. Жаныбекова С.Ш.; к.б.н. Акбергенов Р.Ж.; д.б.н. Шайхин С.М.; к.б.н. Жигайлов А.В. Кроме того, Б.К. Искаков является основателем Казахстанской научной школы в области генной инженерии растений по улучшению их устойчивости к фитопатогенным вирусам и абиотическим факторам среды. В этой области подготовлены ученики: к.б.н. Карпова О.В.; к.б.н. Низкородова А.С.; Ph.D. Крылдаков Р.В.
- Школа академика НАН РК Н.А. Айтхожиной, основателя молекулярной генетики и молекулярной медицины в Казахстане (ученица академика АН СССР, лауреата Ленинской премии Георгиева Георгия Павловича, директора Института биологии гена РАН). Основное научное направление – геном человека, молекулярная медицина, геном растений, регуляция активности генов, генодиагностика, молекулярные основы наследственных и ген опосредованных заболеваний. Коллектив сотрудников, продолжающий развивать эти направления в настоящее время, работает в ИМББ им. М.А. Айтхожина и в других научных центрах, НИИ РК.
- Школа биохимика член-корр. АН КазССР Л.К. Клышева. Основное научное направление школы – «Метаболизм вторичных соединений в растениях, энзимология их обмена и регуляция», направление, которое продолжила Лаборатория сигнальных систем растений.
- Школа академика АН КазССР Н.Д. Беклемишева. Основное научное направление школы – «Экспериментальная и клиническая аллергология и иммунология». Направление молекулярной иммунологии и иммунобиотехнологии начало формироваться в Институте молекулярной биологии и биохимии им. М.А.Айтхожина под руководством д.б.н., проф. Н.Н. Беляева, ученика Н.Д. Беклемишева. В настоящее время традиции школы поддерживаются и развиваются Лабораторией молекулярной иммунологии и иммунобиотехнологии (И.о. зав. Лаб. к.б.н. Тлеулиева Р.Т.)
- Школа д.б.н., проф. Перуанского Ю.В. — одного из основателей биохимии, физиологии и биотехнологии сельскохозяйственных растений. Основное научное направление школы – «Биохимические основы повышения продуктивности зерновых культур», продолжается Лабораторией биохимии зерновых культур (зав. Лаб. к.б.н. Хакимжанов А.А.).